大蒜通常不能有效治疗衣原体感染。这种感染主要影响呼吸系统，可能导致肺炎、支气管炎等疾病。虽然大蒜有一定的抗病原微生物作用，但它并不能杀灭衣原体。对于衣原体感染，专业的抗感染治疗是必不可少的，通常需要使用特定的抗生素。

1、抗生素治疗：衣原体感染的治疗主要依靠抗生素，常用的药物包括阿莫西林、莫西沙星等青霉素类药物，以及红霉素、罗红霉素等大环内酯类药物，还有阿奇霉素、克拉霉素等喹诺酮类药物。这些药物能够有效抑制和杀灭衣原体，帮助患者恢复健康。

2、大蒜的作用及局限性：大蒜确实具有一定的抗病原微生物作用，这主要是通过抑制病原微生物的蛋白质来实现的。然而，这种作用并不足以对抗衣原体感染。大蒜的抗微生物能力在某些情况下可能有助于预防感染，但不能替代专业的医疗治疗。

3、眼部感染的风险：衣原体感染还可能引发沙眼，如果不当使用大蒜，可能会刺激眼部，导致不适甚至损伤。使用大蒜治疗眼部感染是不可取的。

如果怀疑自己感染了衣原体，最明智的做法是尽快就医，遵循医生的建议进行治疗。不要依赖大蒜等民间疗法，以免延误病情或引发过敏反应，比如皮肤瘙痒或红肿。正确的医疗干预是确保健康的关键。