支原体阳性吃了两个星期的药还是阳性可能是因为用药不当、病情较严重、对药物不敏感、耐药性、交叉感染等原因引起的。建议及时去医院就诊，在医生的指导下选择合适的治疗方法进行治疗。

1、用药不当：

在服药期间没有根据医生指导剂量和用药时间服用，擅自停药或减少药量，从而影响疾病恢复效果。建议严格遵医嘱治疗，以确保药物充分发挥作用。

2、病情较严重：

可能是患者病情较严重，且个人体质较差，则治疗需要更长的时间。建议在医生指导下更换其他药物或是调整药物剂量。

3、对药物不敏感：

患者可能是对药物不敏感，导致药物无法发挥作用。在这种情况下应及时就医，更改治疗方案，以免延误病情。

4、耐药性：

患者可能长期或不当使用抗生素导致支原体对药物产生抗药性，使药物无法发挥作用。需要遵医嘱采用其他方法治疗。

5、交叉感染：

在日常生活中，如果患者没有注意自身的卫生，存在不洁的性生活，或者与感染者间接接触，也可能引起交叉感染的情况。建议患者注意个人卫生、避免不洁性生活和接触传染，预防支原体阳性复发。

在治疗期间，患者也要注意饮食健康，多吃富含蛋白质、维生素C的食物，如鸡蛋、牛奶、橙子等，为身体补充所需要的营养。